Hola jfernandezh

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Los archivos con información de la SRTM (shuttle radar topography mission) se pueden descargar gratuitamente y para uso libre -hasta donde tengo entendido- de diversas fuentes, incluyendo la USGS (
http://seamless.usgs.gov/) o incluso los servidores web de la nasa (
http://www2.jpl.nasa.gov/srtm/cbanddataproducts.html). La página que mencionas es un aplciación nueva de la USGS para descargar archivos de todo el mundo, lo cual sirvió para separar la información ajena de EU que ahora se desacargar del servidor Seamless. Los archivos están disponibles en varios formatos como HGT, BIL, JPG2000 o DTED, sin embargo, depende la fuente de información el tipo de archivo. Para el caso concreto de la página de la USGS que mencionas, en efecto las opciones son: BIL y DTED.
Desafortunadamente nunca he usado MatLab, sin embargo, ambos formatos, el BIL y el DTED son formatos similares para despliegue de información. El formato BIL puede usarse para cualquier tipo de dato raster pues almacena información en cada pixel. En el caso de los archivos que se ofrecen en la página que mencionas, es un grid con información topográfica que puede leerse desde prácticamente cualquier programa SIG y, salvo el caso de Estados Unidos, todo el mundo tiene una resolución de 3 de arco, en otras palabras, cada lado de cada pixel del archivo BIL equivale a 90 metros aproximadamente.
Ahora bien, el formato de archivo DTED hasta donde sé, es único, o sea que todos los archivos son .dt# aunque como bien mencionas, el número indica una resolución diferente. Por ejemplo, hay archivos dt2, lo que quiere decir que su nivel de definición es el 2 y que su resolución es de 1 de arco (30 m aprox. - para el caso de los archivos de la SRTM, únicamente EU tiene esa resolución).
En resumen, dt0, dt1 y dt2 indica la resolución, todo el mundo tiene datos dt1 de la SRTM y son archivos simples que se pueden leer por programas como MatLab -según dices- y no debería haber ningún problema en leer archivos de diferentes niveles. A diferencia de los archivos BIL (band interleaved by line), un DTED (Digital Terrain Elevation Data) no necesita información espacial que le indique al programa su sistema de coordenadas, y tampoco necesita archivos suplementarios que permitan visualizarlo correctamente.
Un archivo BIL puede estar constituido de al menos 5 archivos ASCII complementarios:
Citar:
"The header file (.hdr) describes the nature of the image data, through the use of keywords and values.
The statistics file (.stx) is an optional file that describes the image statistics for each spectral band. It records the minimum and maximum pixel values, the mean, the standard deviation, and the two linear contrast stretch parameters.
The resolution file (.blw) describes the height and width of each cell and the coordinate position of the top left cell of the data. It gives the Resolution information with the following lines:
[...]
The color file (.clr) is an optional file that describes the image colormap (this file type is not used in the GPW data).
"http://sedac.custhelp.com/cgi-bin/sedac.cfg/php/enduser/std_adp.php?p_faqid=72&p_created=1014323184 Citar:
Y un archivo PRJ (opcional) que indique el sistema de coordenadas del archivo.
Las carpetas que tu mencionas son carpetas de referencia para que puedas acceder a esos archivos DTED pues éstos se pueden descargar por FTP y sólo basta conocer la longitad y latitud en la que se encuentra la información que buscamos para descargar el archivo en bruto de la región que se requiere. No obstante, los archivos DTED no tienen archivos alternos ni necesitan estar oredenados en carpetas cuando se trabaja con ellos.
Como decía al principio, nunca he usado MatLab, pero intenta manejar los archivos dt# como si estuvieran en las carpetas que mencionas. Si no se pudiera trabajar así, bastaría con almacenarlos en carpetas alusivas a las coordenadas del archivo que descargas. Si te fijas, en la página de resultados, hay un campo que se llama "Entity ID" y ahí aparece la referencia de coordenadas que esperabas encontrar en las carpetas. Si MatLab no te deja utilizar los archivos cuando no están almacenados en carpetas alusivas a sus coordenadas, "emula" la forma como tienes organizados tus archivos dt0.
No deberías tener mayor problema. Espero que esta información te ayude.